Povinnosti s.r.o. sa delia do štyroch okruhov: účtovné, daňové, odvodové a registračné. Väčšina z nich má pevnú lehotu a väčšina sankcií vzniká práve jej zmeškaním, nie zlým výpočtom. Rok 2026 pritom priniesol niekoľko zmien, ktoré menia bežnú agendu — nové pásmo minimálnej dane, iný režim odpočtu DPH pri firemných autách a prípravu na povinnú elektronickú faktúru. Prehľad nižšie zhŕňa, čo musí spoločnosť s ručením obmedzeným splniť a kedy sa oplatí prizvať k vedeniu účtovníctva odborníka.

Aké sú základné povinnosti s.r.o.?

Základné povinnosti s.r.o. vyplývajú zo štyroch predpisov: Obchodného zákonníka, zákona č. 431/2002 Z. z. o účtovníctve, zákona č. 595/2003 Z. z. o dani z príjmov a zákona č. 563/2009 Z. z. o správe daní. Spoločnosť ich má bez ohľadu na to, či podniká aktívne, alebo je bez obratu.

Jedna povinnosť platí naprieč všetkým: spoločnosť zapísaná v obchodnom registri musí so správcom dane komunikovať elektronicky (§ 14 daňového poriadku). Papierové podanie sa považuje za nedoručené. Pri nastavovaní prístupov a mandátnych zmlúv býva praktické riešiť to spolu s daňovým poradenstvom hneď po vzniku firmy — rovnako ako dohodu o tom, kto zabezpečí spracovanie daňového priznania na konci roka.

Aké účtovné povinnosti má spoločnosť s ručením obmedzeným?

Každá s.r.o. musí viesť podvojné účtovníctvo — jednoduché účtovníctvo pre ňu nie je možnosťou. Z toho vyplýva reťaz troch krokov na konci roka:

1. Zostaviť účtovnú závierku ku dňu, ku ktorému sa uzatvárajú účtovné knihy, teda spravidla k 31. decembru.
2. Uložiť ju do registra účtovných závierok. Podľa § 49 ods. 11 zákona o dani z príjmov v lehote na podanie daňového priznania; zákon o účtovníctve v § 23a stanovuje najneskôr šesť mesiacov od dátumu, ku ktorému sa závierka zostavuje. Závierka nie je prílohou priznania, ide o samostatné podanie.
3. Nechať ju schváliť valným zhromaždením. Ak v čase uloženia ešte schválená nie je, ukladá sa neschválená a oznámenie o dátume schválenia sa doplní najneskôr do 15 pracovných dní po schválení.

Súčasťou závierky sú aj poznámky a v prípade splnenia zákonných kritérií výročná správa a audit. Účtovnú dokumentáciu je firma povinná uchovávať po zákonom stanovenú dobu.

Aké daňové povinnosti a lehoty platia v roku 2026?

Daňové povinnosti s.r.o. sú viazané na kalendár. Toto sú tie, ktoré sa týkajú prakticky každej firmy.

Oznámenie o predĺžení lehoty treba podať do uplynutia pôvodnej lehoty, teda do 31. marca. Ide o oznámenie, nie o žiadosť — správca dane ho neschvaľuje. S prípravou podkladov sa preto oplatí začať skôr, než sa lehota začne krátiť.

Minimálnu daň platí firma aj v strate. V roku 2026 má päť pásiem podľa zdaniteľných príjmov: 340 €, 960 €, 1 920 €, 3 840 € a nové najvyššie pásmo 11 520 € pri príjmoch nad 5 000 000 €.

Kedy vzniká s.r.o. povinnosť registrovať sa na DPH?

Registračná povinnosť podľa § 4 zákona č. 222/2004 Z. z. o DPH má dve hranice a každá má iný následok:

• Obrat nad 50 000 € v kalendárnom roku — spoločnosť podáva žiadosť o registráciu do piatich pracovných dní a platiteľom DPH sa stáva od 1. januára nasledujúceho roka.
• Obrat nad 62 500 € — platiteľom sa stáva už dodaním, ktorým bola hranica prekročená, a žiadosť podáva do piatich pracovných dní.

Druhá hranica je tá, ktorá firmy najčastejšie zaskočí, pretože DPH sa vzťahuje už na obchod, ktorým sa limit prekročil. Platiteľ DPH ďalej podáva daňové priznanie k DPH a kontrolný výkaz, pri dodaniach do EÚ aj súhrnný výkaz. Základná sadzba DPH je 23 %, znížené sadzby 19 % a 5 %.

Lepšie je hranicu strážiť dopredu. U jedného klienta sme v auguste 2026 presne vedeli, ktorá faktúra bude posledná bez DPH a ktorá už pôjde s DPH — jednu sme vystavili v ten deň, druhú nasledujúci. Žiadna oprava, žiadny stres.

Aké povinnosti má s.r.o. ako zamestnávateľ?

Ak spoločnosť zamestnáva čo i len jedného človeka — vrátane konateľa s pracovnou alebo mandátnou zmluvou — vznikajú jej povinnosti voči Sociálnej poisťovni a zdravotnej poisťovni. Zamestnávateľ sa musí prihlásiť do registra zamestnávateľov, prihlásiť zamestnanca pred vznikom poistenia, mesačne podávať výkazy a odvádzať poistné.

Od 1. apríla 2026 platí zmena, ktorá zamestnávateľom zvyšuje náklady: náhradu príjmu pri dočasnej pracovnej neschopnosti platí zamestnávateľ za prvých 14 dní namiesto doterajších 10. Sociálna poisťovňa preberá výplatu až potom.

Ktoré povinnosti si nové firmy uvedomia až nakoniec?

Poradie je v našej praxi vždy rovnaké: najprv DPH, potom mzdy a až nakoniec ostatné. Tri povinnosti prídu naozaj neskoro:

• Registrácia zamestnávateľa v Sociálnej a zdravotnej poisťovni. Musí byť hotová skôr, ako zamestnanec nastúpi, nie v deň nástupu.
• Oznamovacie povinnosti pri zrážkovej dani. Napríklad oznámenie o dohode o nevyberaní dane zrážkou podľa § 43 ods. 14 zákona o dani z príjmov. Pokuta za oneskorenie bola v našich prípadoch 100 € — malá suma, no úplne zbytočná.
• Transferová dokumentácia. Povinnosť ju viesť upravuje § 18 zákona o dani z príjmov a jej rozsah určuje usmernenie Ministerstva financií SR. Tento rok vznikla jednej spoločnosti povinnosť viesť úplnú transferovú dokumentáciu len preto, že jeden zo spoločníkov je rezidentom nespolupracujúceho štátu. Nie objemom transakcií, nie veľkosťou firmy, ale rezidenciou spoločníka. Cenová ponuka na dokumentáciu bola 5 200 € bez DPH, a to bez benchmarkov. Toto v žiadnom checkliste pre nové firmy nenájdete.

K tomu treba prirátať dokumentáciu k ochrane osobných údajov podľa nariadenia GDPR a zákona č. 18/2018 Z. z. a pri firmách, ktoré sú povinnými osobami podľa zákona č. 297/2008 Z. z., aj AML dokumentáciu. Obe si firmy často uvedomia až pri kontrole.

Čo je nové v roku 2026 a na čo sa pripraviť v roku 2027?

Tri zmeny, ktoré menia bežnú agendu firmy, sa oplatí poznať dopredu.

Transakčná daň sa zúžila na právnické osoby. Novelou zákona č. 279/2024 Z. z. (zákon č. 272/2025 Z. z.) sú od 1. januára 2026 fyzické osoby – podnikatelia vyňaté z okruhu daňovníkov. Pre s.r.o. daň zostáva: 0,4 % z odpísanej sumy s maximom 40 € za transakciu, 0,8 % pri výbere hotovosti a 2 € ročne za používanú platobnú kartu.

Firemné autá majú nový režim DPH. Prechodné ustanovenie § 85n zákona o DPH, ktoré vložil zákon č. 261/2025 Z. z., zaviedlo paušálny 50 % odpočet DPH pri osobných vozidlách M1 a motocykloch L1e a L3e nadobudnutých od 1. januára 2026 do 30. júna 2028 a pri tovaroch a službách, ktoré s nimi súvisia. Plný odpočet je možný len pri výlučnom používaní na podnikanie: firma to musí oznámiť správcovi dane v lehote na podanie priznania k DPH (§ 85n ods. 9) a viesť elektronickú evidenciu jázd, ktorú na výzvu sprístupní daňovému úradu (§ 85n ods. 6).

Elektronická faktúra bude povinná od 1. januára 2027. Novela zákona o DPH zavádza pre platiteľov DPH povinný jednotný elektronický formát faktúry pri tuzemských B2B a B2G transakciách spolu s hlásením údajov — dodávateľ do 15 dní od vystavenia, odberateľ do 5 dní od prijatia. Dobrovoľná fáza beží od druhého štvrťroka 2026 a je to jediné obdobie, keď sa dá systém otestovať bez rizika pokút. Tie môžu dosiahnuť 10 000 €, pri opakovanom porušení až 100 000 €.

Ako sa pripraviť na povinnú e-faktúru ešte v roku 2026?

Pri e-faktúre nehovoríme zo školenia, ale z vlastnej prevádzky. Účtovníctvo vedieme plne digitálne, bez fyzickej archivácie dokladov, cez platformu Doklado. Prijaté faktúry si necháme doručovať priamo do nej a na povinnú e-faktúru od 1. januára 2027 sme pripravení.

Digitalizáciu trh často vníma ako administratívnu záťaž. Je to naopak: bez priebežných dát nemáte čo optimalizovať, pretože optimalizovať sa dá len to, čo viete v októbri, nie to, čo sa dozviete v marci. E-faktúru preto nepovažujeme za problém, ale za moment, keď sa priebežné dáta stanú štandardom pre všetkých.

Keď sme klientov v lete 2026 cielene obvolali a obišli e-mailom, najväčšie problémy sa opakovali:

• Odkladanie. Typická odpoveď z augusta 2026 znela, že tému majú „zatiaľ vo fáze odkladania upomienky“. Vedia o nej, boli aj na školení, ale nikto ju nemá na stole.
• Nerozlišujú prijímanie a vystavovanie. Prijímanie faktúr vyriešite voľbou certifikovaného poskytovateľa doručovacej služby, takzvaného poštára. Technicky náročné je vystavovanie: fakturačný systém sa musí napojiť na poštára, spravidla cez API. U klienta s obratom približne 70 miliónov eur ročne to riešime od augusta 2026 a už vznikli sklzy pri sprístupnení testovacieho prostredia. Firma, ktorá s tým začne v novembri 2026, to nestihne.
• Nevedia, v akom režime budú. Pri jednom subjekte z neziskového sektora sme z materiálov zistili, že bude faktúry iba prijímať, nie odosielať. Elektronická fakturácia sa dotkne aj mimovládnych organizácií, čo väčšina z nich nečaká.

Do konca roka 2026 odporúčame stihnúť päť krokov v tomto poradí:

1. Zvoliť si poštára, hneď. Finančná správa evidovala v júli 2026 takmer 60 certifikovaných poskytovateľov doručovacej služby a ich sprostredkovateľov. Vybrať sa dá dnes, v decembri to už bude otázka voľnej kapacity.
2. Zistiť, či váš fakturačný softvér nie je certifikovaný sám. Časť dodávateľov certifikáciu poštára má a vtedy si ušetríte celú integráciu.
3. Oddeliť prijímanie od vystavovania. Prijímanie vyriešite voľbou poštára, vystavovanie je technický projekt. Rátajte s mesiacmi, nie s týždňami.
4. Overiť si, v akom režime budete. Nie každý subjekt bude musieť faktúry aj odosielať.
5. Otestovať to v dobrovoľnej fáze ešte v roku 2026. Chyby vo vystavovaní sa tak objavia teraz, a nie vtedy, keď už všetko pôjde priamo na finančnú správu.

Aké sankcie hrozia pri nesplnení povinností?

Sankcie sa líšia podľa toho, ktorá povinnosť zostala nesplnená. Za nepodanie daňového priznania v lehote ukladá správca dane pokutu podľa daňového poriadku, za oneskorenú platbu vzniká úrok z omeškania. Neuloženie účtovnej závierky do registra je správnym deliktom podľa zákona o účtovníctve. Pri opakovanom neplnení povinností môže súd rozhodnúť o zrušení spoločnosti.

Najhoršia situácia, ktorú sme riešili, pritom nebola tá s najvyššou pokutou. Bola to tá, kde sa malý nedoplatok nechal ležať.

Druhou kategóriou sú fixné pokuty za formality, napríklad 100 € za oneskorené oznámenie o nevyberaní dane zrážkou. Treťou, ktorá klientov prekvapí najviac, je kontrola, ktorá nepríde z daňového úradu: u jedného klienta aktuálne prebieha kontrola spotrebnej dane z colného úradu.

Praktický dôsledok býva ešte nepríjemnejší než samotná pokuta: firma bez uloženej závierky sa ťažko dostane k úveru, k verejnej zákazke aj k väčšiemu odberateľovi, ktorý si preveruje protistranu. Najväčšia reálna úspora preto býva sankcia, ktorá nevznikla.

Zhrnutie

Povinnosti s.r.o. tvorí okruh, ktorý sa každý rok opakuje: viesť podvojné účtovníctvo, zostaviť a uložiť účtovnú závierku, podať daňové priznanie do 31. marca, zaplatiť daň alebo aspoň minimálnu daň, strážiť obrat pre DPH a plniť odvodové povinnosti zamestnávateľa. Rok 2026 k tomu pridal nové pásmo minimálnej dane, iný režim DPH pri autách a rozbeh dobrovoľnej fázy elektronickej faktúry. Firma, ktorá si termíny nastaví do kalendára hneď v januári a pravidelne kontroluje osobný účet daňovníka, rieši v marci už len podpis.

Často kladené otázky

Musí s.r.o. podať daňové priznanie, aj keď nemala žiadne príjmy?

Áno. Spoločnosť zapísaná v obchodnom registri podáva daňové priznanie k dani z príjmov právnickej osoby aj vtedy, keď nevykonávala žiadnu činnosť. Zároveň jej vzniká povinnosť zostaviť účtovnú závierku a uložiť ju do registra účtovných závierok. Nulové príjmy neznamenajú nulové povinnosti.

Do kedy musí s.r.o. uložiť účtovnú závierku do registra?

V lehote na podanie daňového priznania podľa § 49 ods. 11 zákona o dani z príjmov, teda spravidla do 31. marca nasledujúceho roka. Ak si spoločnosť predĺži lehotu na podanie priznania oznámením, predlžuje sa aj lehota na uloženie závierky. Zákon o účtovníctve v § 23a stanovuje krajnú hranicu šesť mesiacov od dátumu, ku ktorému sa závierka zostavuje.

Kedy sa s.r.o. musí registrovať za platiteľa DPH?

Ak obrat v kalendárnom roku presiahne 50 000 €, spoločnosť sa stáva platiteľom DPH od 1. januára nasledujúceho roka. Ak obrat presiahne 62 500 €, stáva sa platiteľom už dodaním, ktorým bola hranica prekročená. Žiadosť o registráciu sa v oboch prípadoch podáva do piatich pracovných dní. Obidve hranice upravuje § 4 zákona č. 222/2004 Z. z.

Kedy musí byť firma pripravená na povinnú e-faktúru?

Platitelia DPH musia pri tuzemských B2B a B2G transakciách používať elektronickú faktúru od 1. januára 2027. Keďže napojenie fakturačného systému na certifikovaného poskytovateľa doručovacej služby trvá mesiace, odporúčame zvoliť poskytovateľa a otestovať vystavovanie ešte počas dobrovoľnej fázy v roku 2026.

Skontroloval

Mgr. Pavol Lukáčik

Článok pred zverejnením odborne skontroloval licencovaný daňový poradca a majiteľ spoločnosti Lukáčik & Partners, ktorá od roku 2011 poskytuje daňové, účtovné a mzdové poradenstvo malým a stredným firmám, živnostníkom a fyzickým osobám.

• Daňový poradca, osvedčenie SKDP č. 981/2011, 19 rokov praxe
• Právnická fakulta Trnavskej univerzity
• Know-how z medzinárodnej poradenskej siete
• Člen Slovenskej komory daňových poradcov

Viac o nás Vedenie účtovníctva